PEPR ATLASea - "Etude des espèces marines invasives grâce aux génomes de référence" - Appel à projets

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Le PEPR ATLASea a pour objectif de séquencer et analyser des milliers de génomes de référence issus de la biodiversité marine. Il s’inscrit dans une dynamique internationale dont le but est de mieux comprendre le vivant à travers l’analyse de génomes représentatifs de sa diversité et issus de centaines de millions d’années d’évolution.

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A l’heure où la biodiversité est soumise à une pression anthropique accrue, il est urgent de réaliser cet inventaire, dont l’une des applications est d’accroître notre capacité à étudier, surveiller et préserver les écosystèmes. La biodiversité marine est un enjeu particulièrement important car elle est mal connue mais cependant cruciale pour les équilibres naturels, tant physico-chimiques (production d’oxygène, séquestration du carbone) que biologiques. La France dispose de la deuxième zone économique exclusive marine au monde, et est dotée d’atouts importants pour l’étude de sa biodiversité marine. Ainsi, le PEPR ATLASea fédère des acteurs clés comme le CNRS, le CEA, le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN), l’Ifremer, Sorbonne Université, l’Université Aix-Marseille, Paris Sciences Lettres, et plusieurs stations marines autour de trois projets ciblés : DIVE-Sea pour l’échantillonnage, SEQ-Sea pour le séquençage, et BYTE-Sea pour l’infrastructure informatique.

Le présent appel vise à financer un projet qui exploitera les données produites par les équipes ATLASea et d’autres laboratoires pour étudier des écosystèmes perturbés par l’invasion d’espèces exogènes. A l’interface entre génomique et dynamique des écosystèmes marins, il s’agira de mieux comprendre la dynamique d'invasion afin, entre autres, de faciliter des approches de biosurveillance rigoureuse permettant d’agir de manière précoce. Il s’agit également de comprendre et de préserver des écosystèmes critiques pour la biodiversité, les sociétés humaines et l’économie, avec un accent particulier sur les systèmes côtiers et les pressions anthropiques. Pour répondre à ce défi, des propositions de recherches sont sollicitées afin de créer un consortium.

L'appel à projets se déroulera en 2 phases :

  • Une première phase obligatoire de pré-sélection consistera à déposer des lettres d’intention. Ces lettres expliqueront en quoi l’équipe candidate sera en mesure de contribuer individuellement aux objectifs de l’appel. Un nombre réduit de propositions de lettres sera ensuite retenu après évaluation par un comité d’évaluation interne du PEPR ATLASea, en association avec la présidence du comité d’évaluation des projets complets.
  • Une seconde phase consistera à déposer les projets pré-sélectionnés lors de la première phase pour l’évaluation par un jury international.

Le projet complet aura une durée de 4 ans et un montant d’aide maximale de 2,3M€.

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